사도 요한은 요한복음을 쓴 목적을 "그러나 이것들이 기록된 목적은 여러분들로 하여금 예수가 그리스도이시며 하나님의 아들이심을 믿게 하고 또 믿어서 예수의 이름으로 생명을 얻도록 하기 위함입니다"라고(요 20:31) 밝히고 있다. 곧 요한은 예수님이 하나님의 아들이심을 증거하여(요 3:16) 사람들이 예수님을 믿고 하나님의 자녀가 되게 하려고 이 책을 쓴 것이다(요 1:12). 예수님의 생애를 연대적으로 기록하는 데 비중을 두기보다는 예수님이 하나님의 아들로서 보여 주신 이적과 능력에 대해 많이 기록한 것이 다른 복음서와 다른 점이다(요 2:1-11; 11:1-44 등), 또한 예수님께서 스스로 자신이 어떤 분인지를 밝히는 내용을 기록했다(요 6:35, 48; 8:12; 9:5 등).
